Integración de bases de datos bioinformáticas a la plataforma Multiomix, para mejorar la interpretación de potenciales biomarcadores oncológicos (Record no. 57758)

MARC details
000 -CABECERA
campo de control de longitud fija 04515nam a2200253 a 4500
003 - IDENTIFICADOR DEL NÚMERO DE CONTROL
campo de control AR-LpUFIB
005 - FECHA Y HORA DE LA ÚLTIMA TRANSACCIÓN
campo de control 20250311170525.0
008 - DATOS DE LONGITUD FIJA--INFORMACIÓN GENERAL
campo de control de longitud fija 230201s2023 ag a om 000 0 spa d
024 8# - Otro identificador estandar
Número estándar o código DIF-M8716
-- 8943
-- DIF007986
040 ## - FUENTE DE LA CATALOGACIÓN
Centro catalogador/agencia de origen AR-LpUFIB
Lengua de catalogación spa
Centro/agencia transcriptor AR-LpUFIB
100 1# - ENTRADA PRINCIPAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Bebczuk, Franco
245 10 - MENCIÓN DE TÍTULO
Título Integración de bases de datos bioinformáticas a la plataforma Multiomix, para mejorar la interpretación de potenciales biomarcadores oncológicos
260 ## - PUBLICACIÓN, DISTRIBUCIÓN, ETC.
Fecha de publicación, distribución, etc. 2023
300 ## - DESCRIPCIÓN FÍSICA
Extensión 1 archivo (1,2 MB) :
Otras características físicas il. col.
502 ## - NOTA DE TESIS
Nota de tesis Tesina (Licenciatura en Sistemas) - Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Informática, 2023.
505 0# - NOTA DE CONTENIDO CON FORMATO
Nota de contenido con formato 1. Introducción -- Objetivo general -- Contexto y motivación -- Objetivo detallado - desarrollo propuesto -- Resultados esperados -- 1.1 Definiciones -- Conceptos de medicina y biología molecular -- Cáncer -- Biomarcador -- Biomarcador pronóstico -- Estudios ómicos -- Genómica -- Transcriptómica -- Proteómica -- Dimensiones de Datos en Multiomix -- Transcriptoma -- miRNA -- CNA (Alteraciones Cromosómicas Numéricas) -- Metilación -- Pathways -- Bio Api -- 2. Marco de trabajo -- Stack de tecnología -- Base de datos -- Lenguaje y framework de desarrollo -- Despliegue -- Proceso de desarrollo -- Weeklies -- Organización de tareas -- Colaboracion bioinformaticos y genetistas -- 3. Descripción general de Gene Ontology (GO) -- Conceptos básicos de gene ontology -- Ontología -- Función biológica -- Función molecular -- Componente celular -- Proceso biológico -- Base de conocimientos de Gene ontology -- Recursos primarios de Gene ontology 21 -- Motivación -- 3.1 Integración de ontología GO a BioAPI -- GO slims -- Formato OBO -- Estructura -- Relaciones jerárquicas -- Relaciones no jerárquicas -- Importación -- Actualización -- Schema -- Endpoint -- Motivación -- Definición -- Algoritmos -- BFS jerárquica hacia la raíz -- BFS jerárquica a hijos -- BFS no jerárquica -- Merging de los resultados de los recorridos -- Request -- Respuesta -- Respuesta exitosa -- Cómo representar el subgrafo -- Ejemplo -- Respuesta con error -- Optimizaciones -- Índices -- Métricas -- 3.2 Integración anotaciones GO -- Formato GAF -- Homo sapiens -- Importación -- Actualización -- Normalización de alias de genes -- Logs -- Schema -- Endpoint -- Motivación -- Unión -- Intersection -- Algoritmos -- Request -- Respuesta -- Respuesta exitosa -- Ejemplo -- Respuesta con error -- Optimizaciones -- Índices -- Métricas -- Problemas -- Problemas de función de alias -- Problema encontrado en los logs -- Problema de evidencia en bd -- 3.3 Integración de librerías para Gene Enrichment -- Cómo funciona -- Motivación -- Conceptos estadisticos -- P-value (valor p) -- Correction method (método de corrección) -- Librería GOATOOLS -- Estructura de datos diferentes -- Falta de documentación -- Gprofiler -- Librería en R y su wrapper para python -- Anotaciones extra -- Solución -- Búsqueda de anotaciones locales -- Endpoint -- Request -- Respuesta -- Respuesta exitosa -- Ejemplo -- Respuesta con error -- Optimizaciones -- 4. Integración de PharmGKB -- Estructura -- Importación -- Actualización -- Schema -- Endpoint -- Request -- Respuesta -- Respuesta exitosa -- Ejemplo -- Respuesta con error -- Optimizaciones -- Métricas -- Índices -- Problemas -- 5. Integración de STRING -- Archivos -- Importación -- Actualización -- Problemas -- Reducción de Ceros Redundantes -- Redundancia de Relaciones Bidireccionales -- Estructura de base de datos en mongodb -- Endpoint -- Request -- Respuesta -- Respuesta exitosa -- Ejemplo -- Respuesta con error -- 6. Integración de Drugbank -- Motivación -- Licencias -- Licencia académica -- Alternativas -- Scraping -- Crear el proceso de importación y el endpoint vacíos -- Generar un link a drugbank -- Endpoint -- Request -- Respuesta -- Respuesta exitosa -- Ejemplo -- 7. Conclusiones -- Trabajos futuros -- Publicación de paper -- Integración a multiomix -- Próximas versiones -- Bibliografía
650 #4 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada BIOINFORMÁTICA
650 #4 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada BASES DE DATOS
653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO
Término no controlado ingeniería de datos
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Pons, Claudia Fabiana ,
-- Director/a
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Butti, Matías Daniel ,
-- Asesor/a profesional
856 40 - LOCALIZACIÓN Y ACCESO ELECTRÓNICOS
Identificador Uniforme del Recurso <a href=" http://catalogo.info.unlp.edu.ar/meran/getDocument.pl?id=2612"> http://catalogo.info.unlp.edu.ar/meran/getDocument.pl?id=2612</a>
942 ## - ELEMENTOS DE PUNTO DE ACCESO ADICIONAL (KOHA)
Tipo de ítem Koha Tesis de posgrado
Holdings
Estado de retiro Estado de pérdida Estado dañado Disponibilidad Biblioteca permanente Biblioteca actual Fecha de adquisición Número de inventario Total de préstamos Signatura topográfica completa Código de barras Fecha visto por última vez Precio válido a partir de Tipo de ítem Koha Colección Identificador Uniforme del Recurso
      Préstamo a domicilio Biblioteca de la Facultad de Informática Biblioteca de la Facultad de Informática 11/03/2025 DIF-05282   TES 23/23 DIF-05282 11/03/2025 11/03/2025 Tesis de posgrado    
      Recurso en Línea Biblioteca de la Facultad de Informática Biblioteca de la Facultad de Informática 11/03/2025         11/03/2025 11/03/2025 Tesis de posgrado Biblioteca digital http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/162231
      Recurso en Línea Biblioteca de la Facultad de Informática Biblioteca de la Facultad de Informática 11/03/2025         11/03/2025 11/03/2025 Tesis de posgrado Biblioteca digital http://catalogo.info.unlp.edu.ar/meran/getDocument.pl?id=2612